修剪可以调节苹果苗木各部分、各器官之间的平衡关系。由于修剪，在不减少根系，不减少吸收量的前提下，使树冠的枝梢有所减少，因而能促进留下来的枝梢的生长，提高光合效率。另一方面，由于修剪使叶面积减少，总生长量减少，光合产物和供给根系的养分也会相应减少，会使根生长受到抑制，反过来又影响地上部的生长。因此，修剪在总体上是有抑制作用的，刺激生长的作用只能表现在局部，这表现了修剪对苹果树地上部和地下部动态平衡关系的调节作用。可以通过修剪来调节营养生长和生殖生长的关系，使这两类器官保持相对的平衡，以达到稳产、高产的目的。合理修剪能使年年有一定的生长，形成足够的花芽，结出一定数量的果实。花芽少时，修剪上要尽量保留花芽，缓和营养生长势，促使由营养生长转向生殖生长;花芽多时，要进行疏花疏果，减少结果量，并进行短截回缩，促进营养生长;同时可以利用苹果树各器官、各部分的相对独立性，使一部分枝梢生长、一部分枝梢结果，每年交替，相互转化，使营养生长和生殖生长达到相对平衡。
苹果苗木的同类器官也存在着矛盾并互相竞争，需要通过修剪加以调整。对枝条，要保持其一定数量，同时要使长、中、短枝保持一定的比例。长枝过多时，生长期长，用于生长消耗的营养物质过多，积累不够，影响短枝生长和花芽分化;长枝过少时，总的营养生长势变弱，也不利于营养物质的生产和积累，不利于生长和结果。对短枝，首先应保持优良短枝的数量，同时疏除质量过差的短枝，使一般短枝向优良短枝转化。
修剪作用的实质是通过调节苹果苗木与环境的关系，保持各器官的数量与质量，调节苹果树对养分的吸收、营养物质的制造、分配和利用等，从而解决苹果树生长与结果的矛盾，达到连年丰产的目的。因此，修剪必须符合苹果树本身的生长结果习性，并在良好的土、肥、水管理基础上进行。
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